另立新帝的過程也很簡單。
甚至比眾人想象中的都簡單。
控制中央政權，掌握洛陽衛戊軍隊的兵權極為重要，董卓便具體部署，派心腹大將呂布殺掉執金吾，接收全部京城防衛部隊。從此，董卓不僅控制大量常規部隊，而且還掌握著洛陽的直屬部隊，完全具備了左右朝政的軍事基礎。
這為他的野心進一步膨脹增加了相當分量的籌碼。
有了強大的軍事后盾，董卓便有恃無恐，為所欲為。首先他迫使朝廷免除司空劉弘的職務，自己取而代之。
接著，為了進一步獨攬中央政權，董卓決定召集文武百官商議廢除少帝，另立新皇帝。
在一次會議上，董卓肆無忌憚地說：
“少帝愚昧懦弱，不能敬奉宗廟，沒有資格擔任天下的君主。為了國家和漢室江山著想，我想效法伊尹放太甲，霍光廢昌邑的故事，廢掉少帝，改立陳留王劉協為天子！”
在場官員大多懾于董卓的淫威，對他獨斷專行、隨心所欲的行為敢怒不敢言。
只有尚書盧植當面提出反對意見，認為少帝只是年紀幼小，行為品性根本就不能與太甲和昌邑王相提并論。
董卓大怒，沒想到盧植如此不敬，膽敢當眾反對自己，便立即命令士兵將他推出斬首，幸虧侍中蔡邕極力勸阻，盧植才免于一死。
之后，董卓廢掉少帝，將他貶為弘農王；另立陳留王劉協，即為漢獻帝。
廢立皇帝之后，董卓又對何太后看不順眼，認為她有礙自己在朝廷上下自由行動和樹立威信。
于是，董卓又大會群臣，向大臣們數落太后所謂的罪行，說她如何如何逼迫婆母永樂皇太后，以致皇太后憂慮而死。這種違背婆媳常理、不講孝順禮節的教法，應當受到嚴厲懲處。之后，董卓便責令何太后遷居永安宮，不久，董卓又借故殺死少帝劉辯，毒死何太后。
改立獻帝之后，董卓將自己升遷為太尉，成為三公之一，掌管全國軍事和前將軍事務，后又自封郡侯，拜國相，躍居三公之首，掌宰相權。
董卓雖然名為一人之下，萬人之上的國相，但實際上卻遠遠超越皇帝，享有贊拜不名、入朝不趨、劍履上殿等特權。
自己加官進爵后，董卓還利用自己手中的特權，大肆加封董氏家族成員。他首先封自己的母親為池陽君，越禮配備家令和家臣，地位與皇家公主相當。
同時，董卓又拜弟弟董旻為左將軍，封雩侯，另外還封自己年幼的孫女為謂陽君。為了更有效地控制皇帝，董卓不顧朝臣反對，脅迫獻帝將都城從洛陽西遷至長安。
董卓還無視禮制和皇威，在自己的封地修筑了與長安城墻規模相當的塢堡，高厚達七丈，明目張膽地用萬歲塢來命名，并規定，任何官員經過他的封地時，都必須下馬，恭恭敬敬地對他行大禮。
董卓培養的軍隊兇悍強壯、戰斗力極強，不過他們到哪破壞力也是相當了得的。
他的軍隊進入到洛陽后，洛陽當地是非常富饒的，這批軍人在洛陽為所欲為，有打劫人家錢財的，有吃霸王餐不給錢的，更有些人強搶良家婦女，有的甚至連皇室的公主都不放過，弄得家家是雞犬不留民不聊生，董卓卻名曰籠絡軍心。
董卓還趁太后下葬時，去先皇的陵墓中掠奪金銀珠寶，在祭祀時，假裝自己并非有意派兵，將全場的所有男子都殺死，把他們的頭看下來系在馬車上，把那里所有的婦女裝進馬車里，到了洛陽后讓士兵們把男人的頭都燒了，把這些婦女們都賞給了那些士兵。
也正是如此，董卓手下的那些軍隊，對董卓一直都是忠心耿耿。
可以說，只要董卓不死，別人很難從董卓手中真正的掌控軍隊。
其實，這也怪不得董卓。