七天之后，悲怮的氣息在木葉村內彌漫。
這一天，木葉村全村男女老少都穿上黑色服裝，天空也像是很配合木葉村的氛圍一樣降下雨水。
木葉村所有忍者都聚集在慰靈碑前，獻上自己的哀悼。
這是一場注定沒有遺體的哀悼會，因為所有影級的尸體都被封印起來，找不到任何蹤跡。
五代火影、三代火影的死亡是木葉村史無前例的災難，因為自從木葉村建村以來，就從沒有發生過兩代影在同一天死亡的情況。
這對于木葉村毫無疑問是一次巨大的打擊，村內的村民以及忍者無一不為木葉村未來的前途擔憂。
好在志村團藏在臨死之前指名自來也回村擔任火影，所以暗部以及根部在確認三代火影以及五代火影死亡的第一時間就出發去尋找自來也了。
木葉村不能群龍無首，尤其是一口氣兩名影級隕落，更有可能給他國忍者進攻的機會。
所以心系木葉村的自來也臨危受命，回到木葉村主持大局。
但當兩名木葉顧問提出讓自來也正式成為第六代火影的時候，自來也拒絕了。
理由是自己現在回來只是為了幫助木葉村度過難關，但他這個人自由散漫慣了，如果要成為正式火影的話，有比他更合適的人選。
木葉顧問仔細一想，覺得自來也說的也對，畢竟一村之影是個遠近聞名的好se之徒，傳出去對木葉村的名聲十分不好。
但當木葉顧問詢問自來也心目中更合適的火影人選是誰，自來也回答是綱手時，木葉顧問覺得好像這兩人都差不多。
最終，自來也還是成為了在正式決定六代火影之前的代理火影。
自來也上任后，立刻著手統計木葉村在這次事件中的損失，很快便統計出了結果。
這次事件中木葉村死亡人數平民加上忍者共計208人，其中大部分是忍者，而忍者之中的中忍死亡人數最多。
除此之外還有不計其數的傷者和建筑損失，木葉醫院一時間人滿為患，不得不在外面搭起醫療帳篷，街道上也隨處可見居民搭建的臨時帳篷。
除了這些明面上的損失之外，木葉村還損失了一些重要的研究資料。
在大蛇丸、羅砂、志村團藏、猿飛日斬的交戰期間，木葉研究所遭到強力忍者的進攻。
不同于其他地方大批進攻的砂忍，進攻這里的只有一名精銳忍者。
這名忍者闖入木葉地下研究所中，將之前木葉村獲取的研究資料給全部盜走，包括鉆地魔蟲的尸體、在滅族之夜中宇智波一族駐地內發現的飛天大蛇骨骸。
等到紅豆帶領人員前來支援，發現這個獨自一人進攻木葉研究所的忍者就是大蛇丸的手下，音忍，輝夜君麻呂。
紅豆未能阻止君麻呂的逃跑，所以木葉村掌握的這些關于神奇物種的珍貴資料算是徹底失去了。
但是讓自來也有些懷疑的是，這個音忍趁亂來偷取這些研究資料，肯定是大蛇丸授意的，畢竟大蛇丸是一個徹徹底底的科研狂人。
但大蛇丸已經死了，這個音忍為什么還要來偷這些資料，就算偷回去也不可能有人研究。
是這個音忍不知道大蛇丸在戰斗中死亡了？
還是...
自來也心中感覺到有些許的不對勁兒，但又無暇去顧及這些，因為現在比大蛇丸個人問題重要的事情還有很多。
木葉村兩位火影一死，在這內憂外患的時刻，自來也迅速做出反應。