工部排在六部最末，也是最后調整。
之前被傳言成為九卿的商周祚，這次真的成了九卿。成為六部尚書之中，排名最后的工部尚書。
他在商業、火器上表現出的才干，讓朱由檢很是看重。
薛鳳翔被調任兵部尚書，也有給商周祚騰出位置的用意。
商周祚空出來的工部左侍郎，被群臣廷推南京戶部尚書李待問接任，加正二品議政大臣銜。
此人曾任江南巡撫，也是財政上的干才。朱由檢調他進京，掌管工部商務司。
工部右侍郎張文郁，職位保留不變。
他是天啟二年進士，在天啟年間迅速擢升為侍郎，如今開始還債——
沒有大的功績，他會在工部右侍郎上擔任很長時間，直到被同科的人趕上來。
之前負責新城的規劃和修建，也不過得到承政使加銜，兼任少府寺卿。
專督大工侍郎何如寵，沒有達到朱由檢的預期。
何如寵在上次廷推大學士時排在第三，差一點就成為大學士，因此被朱由檢放在專督大工侍郎位置上，看看能否勝任。
如今一年多下來，何如寵證明了他就是個詞臣。
此人操行純潔高雅，與人無爭，不輕于求進，而易于引退。
這種操守，雖然為時人推重，但是朱由檢不需要這樣的大臣在工部。
所以何如寵被轉任都察院右都御史，用他清廉的操守，負責監察科道。
新的專督大工侍郎，是原任大理寺卿曹珖。
此人是萬歷二十九年進士，是從戶部、兵部升上來的干才，還曾在河南、山東任職，擁有豐富的治政經驗。
朱由檢用他專督大工，做好天啟皇帝的皇陵修建。
專督河道侍郎李從心，今年已經七十四歲，實在是有些力不從心。
他只能遺憾地放下治理海河事務，轉任資政大臣。
新的專督河道侍郎，是原本的大理寺卿、現在的署理大理院掌院張九德。
他在寧夏治河頗有功績，這次被加了議政大臣銜，負責河道事務。
朱由檢勉勵他治好海河、黃河，以后名列紫閣。
張九德因此深受鼓舞，對于從九卿中退出沒有絲毫怨言。在數月前就開始接手李從心的工作，趁著今年旱災繼續整修海河。
六部之后的都察院，原本的左都御史王永光、右都御史成基命，都被轉任為六部尚書。
在右都御史被任命為何如寵接任后，左都御史一職，朱由檢選擇王在晉擔任。
此人是南京吏部尚書，而且曾擔任過河道總督、遼東經略等職務。朱由檢看他有點能力，調他進京任職。
左副都御史仍舊是張夢鯨，因為負責移民，如今還在出外差。
此人做事勤勉，也是朱由檢最擔心的大臣之一，惟恐這個人被累壞。
甚至朱由檢已經開始物色人選，換個人擔任移民大臣。
僉都御史之中，劉宗周被轉任禮部右侍郎兼太學祭酒，朱由檢選擇高弘圖，接任調查總署職務。
負責檢察總署的楊所修，被朱由檢調任它職。他空出來的職位，由東林黨出身的程注擔任。
接下來要對很多閹黨成員定罪，朱由檢應韓爌的請求，選擇他負責調查總署。