把天災的原因歸咎于泰西人對美洲原住民的滅絕，是因為朱由檢必須為接下來發生的天災找出原因。
在儒家的天人感應理論中，天意與人事是交感相應的。天子如果違背了天意，上天就會降下災異進行譴責和警告。
所以災異出現后，天子要負責任。
這種理論在朱由檢看來很扯淡，但是儒家士子卻緊抱著不放，以此約束君王——
董仲舒的《春秋繁露》，更是把災異說發揚光大。這種學說在兩漢極為盛行，以至于天子不得不找大臣背鍋，讓他們一起擔責任。
因為天子背鍋變成大臣背鍋，天人感應學說在兩漢之后已經不再那么盛行。但是人間出現災荒，仍舊會有人歸罪天子。
歷史上崇禎皇帝下了六次罪己詔，其中有一次是專門因為天災，還有三次包含天災的原因。
鑒于接下來幾十年天災實在太嚴重，朱由檢不想頻繁下罪己詔，就必須要找個解釋，把天災歸罪于他人。
所以，被后世一些科學家推測的小冰期有關的美洲原住民大滅絕，就這樣被他找了出來。以太祖成祖托夢的名義，提前告知群臣——
讓天下人知道以后出現天災，是泰西人殺戮過重的原因，不能怪自己這個天子、逼自己下罪己詔。
群臣不知道皇帝的這個考慮，很多人仍舊有些不信。但是讓他們否認皇帝的說法，同樣也很困難。因為之前給紫閣功臣封城隍，他們已默認了太祖成祖托夢之事為真、天子有冊封神靈的權力。
現在如果否定皇帝的說法，就得把之前封城隍的事情否定。很多臣子對此，都是非常不樂意——
畢竟城隍廟可以有城隍后人當祭司，能夠讓被封神的臣子后裔有世業。對于不信神的臣子來說，也是肉眼可見的利益。
這種給后代謀福利的事情，怎么能推出去呢？
再加上冊封城隍木已成舟，京城很多人都在祭拜，他們就是想反悔，也沒有了機會。
所以群臣對皇帝的說法大多保持沉默，不出言表示支持，但也不會反對。
這樣就給了溫體仁等依附皇帝的臣子發揮的機會，他們積極發言，似乎就代表了沉默的大多數，朝堂上充斥著他們的聲音。
尤其是溫體仁，因為之前曾打算向徐光啟學習西學，推出自己的學問。
在皇帝安排張溥向徐光啟學習、并且推出科學后，溫體仁知道自己的這個想法是破滅了。不過因為曾經的想法，他仍舊可以說是朝堂上最了解泰西人的大臣之一。
通過對這些人秉性的分析，溫體仁認為泰西人畏威而不懷德，和周邊蠻夷無異。
他的這個解釋，很容易讓朝堂上的儒家大臣接受。因為在他們的觀念中，除了大明之外，其他異族都是蠻夷。
這些臣子對泰西人或許不怎么了解，但是批判起蠻夷，那是滔滔不絕。甚至還有人提到了沈纮在南京禁天主教的事情，應該禁絕泰西人傳教。
不過這件事情，遭到徐光啟的激烈反對。作為天主教徒的徐光啟，當然不愿意再一次發生教案。
那些東林黨和傾向東林黨的臣子，因為沈纮是魏忠賢的老師，大多厭惡此人。對沈纮的禁教措施，同樣也不支持。
所以禁止天主教的政策，并沒有被推行。