國子祭酒蔡毅中更率師生千余人堵塞了皇城辦公區，請究魏忠賢罪。當時朝局為之震動，大明政府一時間陷入癱瘓，這下，性子就變了。
歷史上，東林堵塞皇城半月，但這個時代，這個時候是什么時代什么時候皇帝不再被架空，沒有怠政正是雄心勃勃勵精圖治的時候，這是什么時候，是天下全力以赴抗旱救災的時候，你們堵塞辦公不要說半個月，就算一日，都可能造成西北動亂，那會死人的。
于是，在勸說無效的情況下，天啟發難了，將以楊漣為首的六人下獄，罷官東林七十三人，受訓誡懲處的近千人。但后來這些人卻因為這次的戰績，在崇禎上位之后，都成了崇禎朝的大員，開創了君臣斗的作死局面。
后來所謂的六君子被一一刑訊逼供死在了獄中。在歷史上，將六君子的死，都扣在了魏忠賢的腦袋上，但明眼人都知道，別說現在的魏忠賢，就是歷史上這個時期的魏忠賢，在楊漣彈劾他的時候，還要哭泣著求天啟饒命呢，他敢將名滿天下的東林六君子，當時各個都是朝廷的命官的他們殺害嗎他有那個膽子嗎
實際告訴你，要是沒有皇帝的命令，魏忠賢絕對不敢這么做的。
魏忠賢不管多么囂張，他最終還是皇家的一條狗，要他咬誰他才敢咬誰，即便他權勢熏天，崇禎上位，還不是一道詔，就只能在一個小客棧里懸梁自盡。
但這一次，閹黨想對東林窮追猛打還是沒有實現。第一個是，皇上不允許將東林徹底的打垮，破壞他平衡朝局的思想，第二，在毛文龍的號召下，孤臣黨站了出來，維護了三足鼎立的局面。
而最關鍵的是毛文龍寫給魏忠賢的一封信，告訴他，不要再鬧啦，再鬧，對你五千歲大人的名聲不好，是要被歷史唾棄滴。為了顯示你仁厚的大度，你就將那七十三個東林中堅圈禁在王恭廠的首善院里，讓他們反省吧。當然，我會捐一筆錢，擴大王恭廠首善院的規模，讓天下更多的東林有識之士去聽他們的懺悔（鼓動）的。
“至于為什么，老魏，聽我的，得永生。”
于是為了名聲，為了給毛文龍的面子，也是為了得永生，魏忠賢將七十三個東林賢士幽禁在了王恭廠首善院。如此，在東林看來，這是閹黨心虛，這是東林不是勝利的勝利。于是，天下慕名賢士的士子紛紛趕奔王恭廠不斷擴建的首善院聽取講習，一時間最多時有天下賢士五千，真的是盛況空前。
如此，在朝堂上，東林的勢力弱了，但在民間，東林的聲望反倒更高，真正起到了輿論監督的作用，讓閹黨忌憚戰戰兢兢。
當魏忠賢看到這樣的氣勢感覺自己即將有滅頂之災的時候，天啟六年五月初六，一陣毀滅半個北京城，死傷兩萬人的王恭廠大爆炸如期降臨——這個世界安靜啦。
大明都督</p>
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