有意思的是，有人覺得《源代碼》是燒腦的，但是卻偏偏又能看的懂一些。
也有人覺得《源代碼》其實很簡單，可是卻偏偏有一些地方看不懂。
于是隨著電影上映，網絡上開始出現了許多各種各樣，五花八門的解讀，解析的影評。
“有人說《源代碼》太燒腦，但是實際上，《源代碼》的情節很簡單！就像《紅樓夢》需要看懂前五回一樣，《源代碼》只需看懂了第33~35分鐘這2分鐘，就可以理解這部片子了！
這2分鐘里，教授通過解釋大腦的兩個特性來解釋了源代碼的由來，他解讀出來的大腦2個特性就是：1，人死后意識不會立刻消失；2，大腦死亡前意識會留下8分鐘不可磨滅的深刻記憶（殘像）。
總而簡言之，人死后，大腦里都會有8分鐘的記憶不會馬上消失，可被提取、疊加，重建成死者生前最后8分鐘的畫面，該畫面數字化后就形成教授口中的“源代碼”，這里所謂的數字化也許也可以理解為生物信息數字化。
了解了這一點，就不難理解這個超級簡單的故事：
林云斌是一名戰士，2月前在執行任務乘坐直升飛機返還時“死亡”，變成了植物人，注意，這里是植物人，這一點相當重要！，被教授通過合法手段弄到實驗室維持生命，等待接受任務以便開展源代碼計劃。
瘸腿教授等了2個月，終于發生恐怖事件，一輛火車被恐怖襲擊，車上無一生還，恐怖份子還在網上放出消息會繼續在市中心進行一系列恐怖活動。
為了找出兇手，教授立刻趕赴現場采集了所有死者的大腦殘像，并疊加了每個人生前8分鐘的大腦信息，通過生物信息數字化重建了一段僅僅持續8分鐘的源代碼，當然我們或許會疑惑，這個采集重建過程未免有點不可思議的太快了，不過這不是重點，重點是這段源代碼里展示的是一個連續8分鐘的虛擬世界。然后教授找出跟他的植物人林云斌體征比較匹配的其中一名死者李正，作為源代碼入口把原版屬于李正的記憶刪除，并植入林云斌的意識代碼，使其可以進入源代碼中尋求真相。注意，這里原李正的記憶被改寫或刪除了！
因為只是一段生物源代碼，所以教授認為林云斌的意識在源代碼中所做的一切只不過是給源代碼的這段時間重新賦值而已！
包括植入林云斌的意識也是一種重新賦值，不會改變現實世界的既定事實，但是有助于通過對源代碼的不停賦值重組來找到真兇！
其實簡單地說，就相當于電腦的“破解密碼”，林云斌在代碼運行中不同的選擇和決定都是一種重新賦值然后運算出不同結果。
但是教授自己并不知道，他無意中打開通往新世界的大門。