在與寄生生物的戰斗中，飛騎士部隊已經充分證明了自己的價值，她們奮力奪取了戰場的制空權，偵查和傳遞情報，發動對地面的空襲，為多次戰役的最終勝利都立下了大功。
但是，這一次戰爭中，飛騎士們也承受了大量的損傷，寄生飛蟲們強悍的少數個體和龐大的總數量雖然沒能很好的結合起來，卻也給飛騎士部隊帶來巨大的威脅。
哪怕在上一次戰爭中，鋪道蟻帝國的“蚊子”部隊數量同樣眾多，但單體戰斗力孱弱，也不曾給飛騎士帶來這樣的威脅。
如今黑溪前線多次戰役，以及每日都會發生的零星沖突，累計已經造成700余騎飛騎士傷亡，這個損失幅度非常驚人，前線急需大量的補充和擴編。
這一批飛騎士在整訓時，朱爵還根據前線的經驗，對飛騎士部隊的編制進行改組，并準備將新編制逐漸推廣到其他現役飛騎士部隊中去。
最早飛騎士部隊的編制和陸軍差不多，以50騎為一個小隊。但是這樣的編制在戰斗中非常不靈活，由于空中指揮不便，雖然想了很多辦法也只是略有改觀，飛騎士們還是喜歡以騎的小集群戰斗，甚至單打獨斗。
因此每個飛騎士小隊在執行任務時，經常拆分為數量更少的臨時小分隊，由資歷最老的飛騎士擔任指揮官。這樣的應急措施終究不是長久之計。
后來飛騎士的編制進行過一次改革，區分了偵查飛騎士和戰斗飛騎士，均以3騎為一個小分隊，16個小分隊48騎為一個小隊。這樣的編制在對付“蚊子”這樣孱弱的空中之敵時還比較靈活，在這次戰爭中又暴露出3騎編制的小分隊戰斗力不足的問題。
根據這次戰爭的經驗，朱爵再度改革偵查飛騎士和戰斗飛騎士的編制及武器配備。
偵查飛騎士，仍舊以3騎為一個小分隊，保留3騎編制機動靈活的特點。以6個小分隊為一個偵查小隊，總計18騎，縮小了小隊規模，便于在更多區域更廣泛的部署偵查力量大多數區域根本不需要20騎以上的偵查飛騎士執行任務。
偵查飛騎士的坐騎，依然是以絲光綠蠅為主的敏捷快速的蒼蠅，飛騎士著甲，蒼蠅不披甲。武器配備上，偵查飛騎士配備的火彈投石索數量從6枚減少到2枚，還有2枚蛛絲彈、騎槍和顎刀，不安裝空中刮刀，這樣一來降低了火力輸出，卻也減少了負重。
如此偵查飛騎士可以獲得更快的飛行速度，火力也足以自保，不到萬不得已的時候，不再要求偵查飛騎士參與空中格斗。
戰斗飛騎士，則是以5騎為一個小分隊，這樣的小分隊編制比3騎編制在面對寄生蜻蜓等單體戰斗力強的敵方時，更具殺傷力。
6個小分隊30騎戰斗飛騎士為1個小隊，6個小隊180騎為一個大隊，6個大隊1080騎為一個聯隊。
戰斗飛騎士的坐騎是蜜蜂，蟻蜂俱甲，武器維持原狀，包括6枚火彈投石索、2枚蛛絲彈、顎刀、騎槍和空中刮刀。另外每名小分隊長額外攜帶2枚小型燃燒彈，用于實行特殊任務。，，