銀河からのオーロラが、死の鐘を鳴らす新たな物語が始まる。
來自銀河的極光，推動死之鐘聲，嶄新的篇章，就此揭開。
在柯南的干擾下，歷史能否改變？他又是否能等到龍舌蘭？
唯一看透了真相的，是一個從未來回到過去，但外表看似小孩，智慧卻過于常人的，名偵探柯南！
......
產生出這個想法后，工藤新一先是吃了一驚，隨后他就沉默了，因為原因很簡單，他現在是黑戶，在沒有“身份”的情況下，工藤新一他根本住不了酒店賓館，更別提工藤新一他也沒那么多錢。
而未來跟著毛利小五郎或者自己行動，是需要經費的，更別提從風見裕也那借來的十萬日元，是不夠用的。
所以工藤新一最后還是拿走了這張登記識別情報和鑰匙，以防萬一，他還拿走了周藤豪貴身上的所有鑰匙，在衣服間完成變小后，果斷抽出隨身隨帶的繩子，打上速降繩結后，直接從3樓的窗戶跳下。
但依靠繩子的拉力，從窗戶跳下的柯南，并沒有在第一時間掉下來，而是懸在了墻上，等柯南找到位置后，他這才速降進入一樓的窗戶后，收好繩子，進入廁所，找到“自已”。
給“自已”打解好藥喚醒后，柯南迅速從后門離開，避開正面的圍觀群眾，消失不見。
與此同時，米花神社。
隨著一輛suv車停下，櫻樹下的佐藤瑛斗終于等來了自己要等的人，wurenbacher，瓦倫丁。
原來，在佐藤瑛斗從廁所上翻過去時，佐藤瑛斗的左腿被墻壁“撞”到，雖然當時沒事，但現在左腿上己出現一個撕裂傷。
而瓦倫丁雖然身為法醫，但此時正好能包扎佐藤瑛斗左腿上的傷口，并對應資料。
然而當佐藤瑛斗看到瓦倫丁旁邊的那個人后，他的臉色頓時變得蒼白了起來，神色也變得無精打采。
因為此人正是bresso.，是瓦倫丁和佐藤瑛斗的上級。
“河瀨透治、周藤豪貴兩人死了？”出乎佐藤瑛斗的預料，bresso.開門見山的問道。
“......是的，死于我的沖鋒槍槍口下，沖鋒槍的型號是ump，”面對bresso.的問題，佐藤瑛斗猶豫了幾秒才回答道，而佐藤瑛斗的猶豫，卻讓bresso.變得煩燥了起來，不耐煩的說道。
“卡片回收了嗎？”
“沒有，半路殺出個程咬金，他想抓我，但被我甩掉了，看起來是一名偽裝成偵探的持搶便衣。”
“偽裝成偵探的持搶便衣？”
“這事做完后，你休假一段時間，有問題嗎？”
聽到佐藤瑛斗的這句話，重讀了一遍的bresso.，似乎想起了什么，變得難看了起來，咬牙下定決心說道
“當然，沒問題。”
見沒有以往任務失敗處罰，內心欣喜若狂的佐藤瑛斗連忙答道，一旁的瓦倫丁默默包扎傷口。
......
等柯南醒來，他發現自己在一片沙石上，看到背后的緩沖汽墊，柯南這時才反應過來，自己是在建筑工地，眼見有記者趕往前面的百貨大樓，柯南連忙站上電動滑板，從草地離開。
然而當電動滑板開動時，柯南、連同滑板、掉落的頭發，都消失不見了，而在連續兩天沒有找到過去的“自己”后，工藤新一也放棄了搜索，因為他知道，過去的歷史改變了。
...
正如柯南（變柯南了）的預測那樣，因為搶劫犯石川樹的“消失”，巡警部長和狙擊手都沒有出現。
而風見裕也，則在紙上的內容引誘下，帶領公安警察封鎖、清查杯戶城市酒店，最后在柯南的指引下，找到了金城汰一、中山隼人、大竹遙太、小久保正義搶劫四人組，一番槍戰后順利抓捕歸案。