清太宗皇太極于六月十五率百官在沈陽祭太廟，尊奉其父野豬皮努爾哈赤為“承天廣運圣德神功肇紀立極仁孝武皇帝”，廟號太祖；祖父到始祖都尊奉為王。十天后，皇太極大封其臣屬。其諸兄弟子侄、諸外藩蒙古貝勒，及明降將孔有德、耿仲明、尚可喜都封為王。
之后皇太極的動作完全超出楊素的預料，剛剛稱帝便即可出兵！令阿濟格率十萬大軍攻打明朝，自己親率五萬軍隊攻打朝鮮，意圖保住后方的安全，對抗在朝鮮駐守的明軍。
錦衣衛剛剛從遼東送來皇太極命阿濟格率軍入關劫掠的消息，前線就傳來戰報，阿齊格就已經分三路奔向冀北，六月二十七日，阿濟格兵分三路入喜峰口、獨石口。
縱然楊素早已嚴令各方堅壁清野，將百姓回遷至城內，注意防守清兵入侵。但明朝早已腐爛到根子里，皇權不下鄉是常態，但皇帝的命令地方官吏打折扣實施，卻是讓楊素也毫無辦法。
明明已經下嚴旨，敢有不從者當即革職查辦，事后更要交與錦衣衛追責問罪，但地府官吏不斷找理由推諉拖拉，最后旨意被沒有得到完全實施，不光面對清兵突然的入侵，毫無抵抗之力，更使百姓又遭一浩劫。
而獨石口為外長城南北的交通要口，地勢險要易守難攻，更是為長城要隘。為上谷之咽喉，京師之右臂！如此要塞居然被清兵半日而下，
巡關御史王肇坤拒戰，兵敗而死！黃得功奉楊素之命率軍趕往獨石口不曾想大軍剛至半途，便得知獨石口以破，不得已之下只能先命人飛馬向楊素回報，之后率軍退保昌平，以保衛京師重地！
京師戒嚴。楊素手上除黃得功之外無一大將可用，急令只能命方正化守龍泉關，急召盧象升、高起潛、秦良玉所部北上勤王。
幾天后，又命王承恩領尚方寶劍巡視邊關。五日，三路清兵齊齊會于京畿延慶，趁機攻打居庸關，居庸關天下雄關，短短一日便被清兵攻破，清兵在直隸省附近如入無人之境，天下震動！
崇禎九年七月十二日，清兵自天壽山后突現昌平城下，攻昌平城。明總兵巢丕昌作為內應降清，開昌平城門，大股清兵殺入昌平，幸好黃得功率部下拼死抵抗，將清兵逐出城內。否則京城左右再無險可守，京城便成為一座死城！
黃得功所部火器兇猛，清兵數度攻城不下，自身傷亡極大，阿濟格見久攻不下，清兵入關主要還是為了劫掠明朝以彌補自身，不愿再與黃得功死磕，便命阿巴泰帶兵繼續圍城，之后阿濟格與揚古利繼續帶兵入京畿，又相繼攻下良鄉、此時正在圍攻順義。
如今京城已經內已經民心慌慌亂成一團，楊素當時得知獨石口失守，便知曉清兵入關一時已成定局，光憑黃得功一部三萬新練禁軍，便是有燧發槍相助，想要野戰戰勝清軍，簡直是妄想。
當時頂住壓力便強令盡遷京師附近數百萬百姓入京城，一時間京城人滿為患，幸虧楊素親自出面城內暫時由禁軍、錦衣衛統管，又以重典御之，連斬數百趁機作亂之人，這才將將穩住局勢。
此時乾清殿內，京城內所有高級官吏齊聚，在此商議對策，溫體仁率先向楊素進言：“皇上，臣請
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