九月間趁著新軍訓練結束的契機，高義歡對魏武軍的人馬，進行了一次大的整編，以便能夠更好的指揮、調動十萬大軍。
此前，魏武軍只有十個營，最大的編制是一營兵三千三百余人，現在變成十萬人馬，那就是三十個營。
這么多營，要高義歡直接指揮，便有些困難了。
這一次，魏武軍設前后左右中五軍，其中前后左右四軍，都是每軍大概兩個營，再加一個親衛司，共計七千人左右，四軍合計兩萬八千余人。
中軍主將雖是趙大憲，但人馬其實由高義歡親領，規模則要龐大的多，有六營兵，再加一部炮隊，一部斥候，約有兩萬兩千余人。
中軍的實力，幾乎與前后左右四軍的人馬加起來相當，便保證了高義歡對魏武軍的絕對控制。
這樣一來，原來的十個老營兵，加上參加過汝州之戰的新附營，便全部整編進入了五軍之中，共計馬步人馬五萬余人。
這五萬精兵，便算是高義歡的中央禁軍，而新練五萬人馬，則發往地方，承擔地方上的防御任務。
到時候，五萬新軍駐防各地，承擔主要的防守，前后左右四軍駐防府城和省城，統籌一片防區，中軍則跟隨高義歡坐鎮中央，建立一套相對完善的駐防體系。
九月間，魏武軍開始進行一次大規模的整編，大軍進行調動，完成了重新布防。
其中汝寧府、包括鹿邑等地，駐軍新卒一萬五千余人，金聲桓再領左軍七千人，駐守府城，統籌防務。
吳世昭領后軍七千人，新卒一萬五千余人，駐守南陽。
王得仁領右軍三千人，新卒五千，駐防鄖陽府，王光泰領右軍三千，新卒五千，駐守承天府。
剩下的人馬，除了襄陽發去一部鎮守外，大約三萬五千余人，則暫時集結于荊州，開始進行大規模的攻城演練，為攻打夷陵州做準備。
在忙了一個多月后，魏武軍的整編和駐防基本完成，不過這并非魏武軍最后的編制，今后肯定會根據需要，再進行變化。
1645年10月，湖廣大熟，不說湖廣魚米之鄉，便是豫南地區，得益于番薯和玉米的種植，也收獲了不少的糧食。
秋糧征收上來，除去大軍一年所需要的糧食外，府庫中結余的糧食，也還有三十萬石。
眼下高義歡控制的地區，除了鄖陽一府，還要讓高義歡倒貼外，汝寧、南陽、襄陽三府，早已能夠實現糧食自給，并且還能有些結余。
新得承天府和荊州府的糧食產量，則徹底讓高義歡的糧庫充盈起來，一下變成了闊佬。
總的來說，在高義歡南下湖廣之后，原來困擾他的糧食問題，便已經得到很大的緩解。
在軍餉方面，得益于同李自成的交易，使得高義歡給士卒們發放獎賞后，府庫中還有白銀二百萬兩。
有這筆銀子在，只要不打仗，高義歡至少是一年不用擔心兵餉了。
此時秋收已過，高義歡要錢有錢，要糧有糧，且大軍士氣正旺。