第一種，很久以前，第一位幻影旋轉術大師創造了幻影忍者世界，并留下了四件威力無比的幻影旋轉術黃金武器，大師去世后，他的兩個兒子發誓保護這些武器，但哥哥加滿都君王心生邪念，企圖獨占武器，兄弟之間爆發了席卷世界的戰爭…
后來經過新埼玉大學考古系教授「宇美乃須藤」的研究證偽了。
第二種，最開初的忍者之神誕生在一個沒有開始沒有結束永恒不變的綠色帷幕之前，忍者之神起初聽到了域外之聲。那道聲音好似擁有無窮的力量，即使是一陣余聲也能撼動綠色的無際。
忍者之神逆推出忍法帖「蕾忍秘術」，并凝聚出最初「蕾克拉」分給忍界的一眾忍者…
后來經過新埼玉大學考古系教授「宇美乃須藤」及其學生「片倉富士雄」的研究，同樣證偽了。
——這些都是隱藏在世界的陰暗面里，真實的忍者們搞出來的障眼法！全部都是謊言！專家辟謠，忍者就是不存在的！
很顯然，第三種才是「正確的歷史」。
——太古之時。
——又稱為黑暗時代，神話時代。
大致是在公元前3000-2000年。
忍者始祖「勝萬松」誕生。
他是所有忍者的父祖，是忍者中的忍者存在，換句話說就是怒者，這個世界的轉折點就是忍者之祖「勝萬松」的誕生！
就像是涼宮世界里，因為涼宮春日一個念頭而爆發出來的各種各樣的力量，在北斗世界中，上天選擇了北斗初祖修玄，超人拳法開始爆誕！
受到「勝萬松」的影響，忍者們被他的光輝照射到，開始大量誕生了。
勝萬松的諸多弟子，使徒誕生，強大的忍者與氏族遍地開。忍者們在暗中操控、統治著世界各地所有的文明，無數的神話與傳說都在這時發生，宗教神明或是流傳各地的傳說與神話人物，其真面目都是忍者，這些忍者如同神明一樣強大。
后來，勝萬松的最后一名使徒「服部忍者」率領「忍者六騎士」，揭起了對抗怒者的反旗，在慘烈的戰爭以后，忍者之祖被打倒。
“忍者們用空手道統治了平安時代，但平安時代并不平安——忍者大戰忍者，忍者統治凡人，凡人反抗忍者，凡人對抗凡人…之后的歷史就像你知道的一樣，工業革命爆發，兩次的世界大戰爆發，太空探索因為y2k事件與電子戰爭而停頓，但…”
賈基沒有繼續說下去，而小季卻是接過了他的話頭，忍不住出聲——
“但忍者并沒有消失，只不過是「離開了表面的舞臺」。”
在有如浸泡在流水里的奇妙時間感覺中，她——矢本小季，居然就這樣聽著那個從異世界來的男人，講述完了如此不可思議的事情…而她的心情，此時一點也不害怕，反而意外的平靜。
“哈啾！”
少女突然打了個可愛的噴嚏。
她緊了緊身上穿著的加厚校服，覺得今年的冬天有些格外…冷。
因為，可怕的、兇殘的忍者可能就潛伏在她的周邊！！</p>