朱載坖一直在有意識將一些政務交給朱翊釴處理，一方面是為了鍛煉朱翊釴處理政務的能力，另一方面也是逐步將一些日常政務的處理轉移給朱翊釴，朱載坖能夠有更多的時間處理其他事情。
朱載坖很清楚，大明現在的科技力量仍然稍顯不足，朱載坖要集中精力做這件事情，除此之外就是對于文教事業的發展，之前朱載坖也一直致力于擴大大明百姓的受教育程度，開辦各種學校，取得了不小的成果，但是朱載坖認為還遠遠不夠，盡管大明現在官學的數量已經擴充了幾倍之多，但是對于朝廷來說顯然是不夠的。
朝廷需要大量接受過教育的工匠、吏員等，這些人才能夠使得大明持續的發展，朱載坖決定在增加在教育方面的投入，朱載坖親自召見了翰林院掌院學士朱賡和文思院使朱載堉，交給他們一件大事，第一是編撰一套教材，除了經史子集之外，還有就是有關算學、物理、化學、機械的一些基本常識，作為學童的開蒙讀物。
除此之外，就是刊刻永樂大典，朱載坖說道：“成祖皇帝曾言，凡書契以來經史子集百家之書，至于天文、地志、陰陽、醫卜、僧道、技藝之言，修輯一書，毋厭浩繁。所得大典，至為精妙，然深藏宮禁，朕以為甚為不妥，應當刊印天下，令士子們借閱。”
永樂大典乃是成祖所編撰的一套類書，全書繕寫成卷，目錄60卷，成書冊，約3.7億字，匯集古今圖書近8000種，規模、內容超過了前代所有類書。但是這部龐大的類書在編成之后并沒有發揮其應有的作用，長期被深藏于宮內，除了除了在嘉靖時謄抄過一部之外，并沒有再刊刻了，而且在正統十四年，南京文淵閣大火，《永樂大典》所據原稿付之一炬。
嘉靖四十一年，世宗皇帝任命高拱、瞿景淳、張居正等人負責重錄《永樂大典》的工作。吏部和禮部主持了“糊名考試”，選撥出109位善書人。內府調撥了畫匠、砑光匠、紙匠等。惜薪司、光祿寺和翰林院也分別負責木炭、酒飯和“月米”的供應。到隆慶四年，抄寫工程宣告結束，原本歸還南京，其正本貯文淵閣，副本別貯皇史宬。
朱載坖這次命令不是抄寫，而是刊刻整個永樂大典，同時要對永樂大典予以修訂，將當時沒有編撰進去的書籍再編撰進去，這個工程量是極為浩大的，雖然之前都曾有人提議過刊刻，都因“工費浩繁”未能實現。現在朱載坖要求修訂、刊刻永樂大典，對于翰林院這樣的部門來說自然是極為支持的，但是所需要的財力物力是極大的，同時還要重新修訂永樂大典，所需要的人力物力是極大的，以現在翰林院的人力還不足以辦理此事。
朱載坖當然也知道這個問題，僅憑翰林院的人手，難以完成這么大的工作量，朱載坖于是下達詔令，開博學鴻詞科，征召天下的飽學之士來編撰、修訂永樂大典，同時雇傭刊刻工匠，刻印永樂大典，同時在全國的大城市試點興建圖書館，將常用的書籍儲存起來，方便一些貧寒子弟借閱，對于朱載坖的這個想法，朱賡是極為支持的，他趕緊說道：“陛下此舉，天下士子之福音也！”
雖然現在書籍并不昂貴，但是對于普通生員來說，仍然不可能擁有大量的書籍，尤其是一些經過批閱、評注的書籍，只有家資豐厚的人家才能夠購買大量的書籍以供家中子弟參閱，而朝廷以興辦圖書館，使得很多貧寒的學生能夠看到大量的書籍，確實是一件德政。
而朱載坖的想法還遠不止于此，永樂大典是類書，類書雖然能夠兼收并錄，極方策大觀，但“因類取裁”的方法使得人們無法看到書籍的全貌，溯其源流，征其來處。朱載坖要編撰一部叢書，收集天下的藏書，不管文、史、哲、理、工、農、醫，都要予以收集編撰起來，編成一部規模龐大的叢書。
除了朝廷和宮廷的藏書之外，還要大規模的從民間征集圖書，大明民間藏書風氣甚重，民間有大量的藏書家，他們珍藏了大量的古籍善本，朝廷要向他們征集圖書，用以編撰叢書，為了鼓勵這些民間的藏書家將自己的藏書貢獻給朝廷抄錄，朱載坖決定采取獎書、題詠、記名等獎勵辦法：“獎書”即凡進書500種以上者，賜內府善本一部；進書100種以上者，賜內府善本三部。“題詠”，即凡進書百種以上者，擇一精醇之本，由皇帝題詠簡端，以示恩寵。“記名”即在提要中注明采進者或藏書家姓名。
要在大明全國征集圖書，作為編撰叢書的底本，至于相關的則例，朱載坖命令朱賡負責擬定之后向朱載坖上疏即可。
朱載坖剛剛消停了沒有幾天，認為隆慶二十年就這么過去了的時候，兩廣總督殷正茂急報，由于朝廷要在廣西推動改土歸流和大修道路，導致廣西瑤亂再起，而且由于黎朝攻滅了莫氏之后，已經和大明接壤，黎朝和這些瑤族的土司勾結起來作亂，導致這些兩廣的瑤亂規模非常之大，整個廣西現在都亂起來了，兩廣總督殷正茂向朝廷奏報此事，同時請求朝廷速發援兵，征討這些叛亂的瑤族土司。
朱載坖對于這種叛亂自然是不能容忍的，當即要求調動官軍予以征討，但是這次廣西的叛亂確實打亂了朝廷的部署，原本朝廷沒有想到這次的瑤亂規模如此之大，據殷正茂的奏報，廣西的瑤亂總人數不下十萬，甚至已經波及到了廣東，嚴重影響了朝廷在兩廣的統治，而且更為要命的是這些土司和黎朝的相互勾結，使得叛亂更加復雜，朝廷不得不謹慎從事。</p>