當然，朝廷的這些措施都只是對于官軍整個后期體制的宏觀管理，但是最重要的是要解決困擾官軍很久的軍餉問題，士卒的軍餉得不到及時的發放，不僅會影響官軍士氣，更會直接影響到官軍的戰斗力，甚至造成官軍嘩變等事端的出現，對于大明來說，絕非好事。
而且事關士卒們的軍餉發放，絕非小事，是關系到士氣軍心的大事，朱載坖很清楚，這是謹慎謹慎再謹慎的事情，稍不注意，就是出大亂子的，僅靠朱載坖和一幫文臣的想法是不行的，必須要在軍中廣泛的聽取各級將校、士卒們的意見，在予以實行，同時也要等到征虜大軍回歸之后再說。
李成梁和戚繼光在吉林等地掃蕩北虜和女真各部，俘獲北虜一共三萬余，繳獲牛羊馬匹可十萬計，控制了整個松嫩平原，同時戚繼光還向朱載坖上疏，請求在松原衛修筑邊墻，隔斷北虜從蒙古進入遼東的路勁，防止蒙古再度進入遼東，同時日后松原衛也可以成為從遼東征討蒙古的功績出發陣地。
官軍已經基本上完成了這次征討北虜的任務，大軍已經在班師回朝的路上了，朱載坖不僅僅是要準備相應的賞賜等物資，同時還要準備對于統兵大將的封賞，這次官軍大獲全勝，確實是大勝，朝廷肯定是要對參戰的官軍士卒軍官予以封賞，不光是賞賜金銀等物資。
對于表現突出的士卒，要予以提拔，選送兩京軍事學院中深造然后分派下去擔任基層軍官，對于表現優異的軍官們，也要予以升遷的，而重中之重就是兩位主帥蓬萊侯戚繼光和玄菟侯李成梁兩人的賞賜，他們無論是從職務還是從官爵都已經是到頂了，對于他們的封賞才是牽動著朝廷官員們的心。
偏生朱載坖之前沒有對此事有任何表示，使得朝廷上的臣子們也不敢多說，畢竟朱載坖現在君威頗重，很多時候即便是朝廷上有不同的意見，朱載坖也能夠利用自己的威信將其推行下去，尤其是事關封爵、賞功等大事，朱載坖從不聽臣子之言，往往是自己作出決定。
朱載坖問道：“諸位以為，此戰賞功應該如何辦啊，尤其是戚繼光、李成梁？”
張居正說道：“陛下，非常之功以非常之賞，此恩出于上也，臣等不敢置喙。”張居正認為這些大將們的封賞，必須是朱載坖本人親自決定，而不是由臣子們決定，而朱載坖讓臣子們離開之后，問太子道：“這次的賞功，你有什么想說的嗎？”
太子朱翊釴認為，這次官軍確實是取得大勝了，朝廷也確實是應該重賞有功的將士們，但是李成梁、戚繼光似乎爵祿已極，是否應該采取其他方式，比如推恩于家人等辦法，朱載坖聽了之后只是笑了笑，其實大家為什么不說戚繼光、李成梁兩人的賞功問題，因為這次確實是非常之功，徹底消滅了土蠻部，接觸了北虜對于大明遼東、薊鎮等威脅，同時還俘獲了蒙古大汗，對于大明來說，確實是非常之功，所以肯定是要厚加賞賜的，但是戚繼光、李成梁已經位居侯爵，再封賞就只能晉封國公，群臣們當然是不愿意再多一位國公的，但是他們有沒有過硬的理由來反對，所以只能夠將此事交給朱載坖圣裁了。
而朱載坖的態度是很明確的，當賞則賞，當罰則罰，絕對不多說，既然李成梁和戚繼光立下了這么大的功勞，朝廷自然是給予賞賜，朱載坖當日下午就傳出旨意，蓬萊侯戚繼光晉封莒國公予世襲三代，玄菟侯李成梁晉封襄國公予世襲三代，同時命令太子朱翊釴親往迎接征虜大軍。
朱載坖的旨意并沒有出乎臣子們的意料之外，立下這么大的功勞，自然是要重賞的，這點臣子們是很清楚的，隨后朱載坖再次發布詔令，提督薊遼軍務黑春封撫順伯，調任前都督府右都督掌行前軍都督府事，其子黑云龍調三千營游擊。
原薊鎮總兵英國公張元功加少保，調提督薊遼大寧等處軍務總兵官。
曹國公李言恭調京衛都指揮使兼掌親軍諸衛，仍充領侍衛內大臣，定國公徐文壁調領侍衛內大臣兼掌紅盔將軍，管帶侍衛處。
襄國公李成梁任總督京營戎政，莒國公戚繼光任中軍都督府左都督兼掌班操京軍，武定侯郭大乾任中軍都督府右都督掌行中軍都督府事，黔國公沐昌祚加后軍都督右都督掌行后軍都督府事，原緬甸鎮總兵鄧子龍升任提督緬甸等處水陸軍務事。
升原寧夏鎮總兵麻貴為左軍都督府右都督兼掌行左軍都督府事，同時調提督倭國水陸軍務事吳惟忠回京，升陳璘提督倭國水陸軍務事，李如松也調回京師，李如松掛征西將軍印充提督陜西三邊軍務。
吳惟忠加右軍都督府右都督兼掌行右軍都督府事，朱載坖通過一系列的人事任命，對于大明官軍的指揮機構予以重建，同時朱載坖原本準備加恩于戚繼光的子弟，但是由于戚繼光的兒子們年齡不大，只能先在武學中讀書然后在京營、親軍諸衛中歷練，朱載坖推恩于戚繼光的侄子戚金，任命戚金為中都留守司留守，負責整頓中都留守司。
同時除平時的賞銀之外，朱載坖出內帑金二十萬兩，鑄造征虜賞功金幣，發給全體參戰士卒和戰歿士卒的遺屬，同時對于這次戰歿、負傷的士卒們要妥善安排，不僅要直接給予賞賜，還要蠲免賦稅，對于戰歿士卒的遺孤，朱載坖命令各級地方官府要送這些遺孤上學，善給衣食，愿意參加科舉的要資助參加科舉，愿意投軍的可以直接參加各軍事學院的考選，也可以送羽林左右衛、府軍前衛當兵，現在親軍諸衛中鍛煉。
還有為官軍運輸糧秣的衛所士卒、民夫等，也要予以賞賜，他們主要是給予糧食等實物的賞賜。</p>