就在王世充指揮著自己所在的戰船趁著一片混戰脫離戰場之時，蔣元超和孫士漢之間的戰斗也到了最后關頭。
因為戰船數量上的劣勢，孫士漢一方已經是敗勢盡顯，不僅有十幾艘戰船被擊沉，死傷者更是不計其數。
蔣元超一方雖說傷亡也沒好到哪里去，但慘勝也是勝，因此他內心還是大感痛快，甚至再次隔江嘲諷起了孫士漢來：
“孫士漢，別以為我不知道，你一直不服我，到處跟人說我水戰本事不如你，不配做江南水師的將軍。
今日我們真刀真槍干了一仗，結果又如何？事到如今，你還有什么好說的？”
面對蔣元超的嘲諷，孫士漢卻興致缺缺，甚至提不起一點反唇相譏的氣力。
他看著江面上漂浮得到處都是的斷裂木板，以及那些抱著木板大聲呼救的士兵，再看著岸上同樣漸漸失去懸念的戰斗，面色一片灰暗，半個字也說不出來。
此時，蔣元超越發得意的聲音又再次傳入他的耳中：
“孫士漢，如果你還想保住自己一條狗命的話，現在就立即升起白旗投降，興許本將軍心情好了，還能大發善心饒你不死。”
短短幾句話可謂是極盡羞辱，可孫士漢就像是什么都沒聽到一般，只是怔怔看著眼前的一切，眼底是無盡的絕望。
他知道自己已經敗了，敗得一塌糊涂。
他也知道以蔣元超和沈法興的為人，自己一旦被生擒，會落得一個怎樣的下場。
與其落在他們手中生不如死，倒不如自我了結來得干脆。
想到此處，他當即拔出腰間佩劍，在身旁所有人沒有反應過來之時，一劍割斷自己的咽喉，當場自刎身亡。
孫士漢一死，其他將士再無斗志，殘余的戰船接二連三升起了白旗投降。
至此，在付出二十幾艘戰船被擊沉和上千名水兵傷亡的代價之后，江南水師還是平定了副將孫士漢的叛逃。
此時，岸上的戰斗也以沈軍大獲全勝而告終，因為王世充及其一眾子侄的臨陣脫逃，導致王軍士氣迅速瓦解，不少士兵見勢不妙，根本無心戀戰，也紛紛跟著溜之大吉，剩下的人眼見逃不掉，便紛紛放下兵器向沈軍投降。
此時天已經微微亮了，蔣元超眼見岸上的戰斗也結束了，正想下令全部戰船靠岸休整，自己要親自去跟沈法興報捷之時，一艘快船卻鼓足風帆自西面而來，船上的人灰頭土臉，隔著江面大老遠就朝著船隊的方向高呼道：
“蔣將軍，大事不好了，水寨被燒了……”
“什么？水寨被燒了！”
聽到江南水寨被燒，蔣元超只覺得眼前一黑，險些當場昏厥過去。
江南水師的其他將士同樣是聽得一清二楚，一個個也是一陣駭然。
沒想到他們傾巢而出追擊叛逃的戰船，后方的水寨被人給偷襲了。
就在他們一個個還在思考到底是誰偷襲了江南水寨，北方的江面上卻突然響起了隆隆的戰鼓聲，聽得剛剛經歷過一場大戰的江南水師將士內心不由跟著一顫……
此時，岸上的沈法興同樣聽到了江面上突如其來的戰鼓聲，面色陡然一片慘白。