只不過在他們和真正的一年級小孩吉田步美等人一起遇到了幾起案件，拗不過吉田步美他們的熱情，加入了所謂的少年偵探團之后，他們之間的關系也拉近了許多。
宮野明美十分樂于見到自己妹妹跟吉田步美等真正的小孩子交朋友，讓這些天真善良的孩子溫暖自己妹妹的內心，彌補妹妹缺失的童年。
灰原哀察覺到自己姐姐的想法之后，也耐著性子陪吉田步美等小孩子一起玩了幾次，雖然還是感覺他們很幼稚，但天真善良的孩子的確是非常治愈的存在。
灰原哀現在脫離了組織，得到了景原的庇佑，姐姐也在身邊陪伴著她，還在學校里交上了朋友，于是她的高冷面具就一日比一日軟化了。
這一天在柯南又一次湊到她身邊來請求她的時候，有些心軟的她無奈的說道：“行了行了，大偵探別總想著在我這里打探消息了，我今天帶你去個地方吧。”
本來以為今天又是要做無用功的柯南驚喜的看著灰原哀：“去哪里？”
灰原哀警覺的看了一眼走在前面的吉田步美等三個小孩子，說道：“待會兒再說。”畢竟那個地方可不適合帶真正的小孩子過去。
在與吉田步美等人在路口分開，各回各家之后，柯南悄悄繞了路跟灰原哀匯合了，他又問了一次：“你要帶我去哪里？”
灰原哀還是沒有告訴他，只說道：“你跟著我走就是了，反正不會把你賣掉的，大偵探。”
柯南對灰原哀還是有基本信任的，畢竟能夠被跡部警官納入庇護之下，就說明灰原哀不是壞人。
而且之前他們少年偵探團一起經歷了好幾起案件，灰原哀在危險時刻保護吉田步美等孩子的行為，也被柯南看在了眼里。
柯南自然不會擔心灰原哀想把自己帶去哪里賣掉。
柯南跟著灰原哀來到了一個看起來十分普通的一戶建房子門前。
然后他就看見灰原哀拿出鑰匙打開了房門，走了進去，他連忙跟了上去。
這個一戶建從外表上看起來普普通通，但內里卻別有洞天，在這里地下竟然建了一座不小的地下實驗室。
柯南隱隱猜到了這里是什么地方了。
灰原哀對他說道：“這個實驗室是跡部警官給我準備的，距離警視廳很近，安全性很高。而且跡部警官不知用了什么辦法拿到了組織里aptx4869的全部研究資料，我已經開始進行解藥的研究了。”
柯南驚喜無比：“真的嗎？那太好了！”他這么心焦的想要追查組織，不僅是因為他的正義感讓他無法對這種犯罪組織視而不見，也因為他迫切的想要恢復原本的身份。
現在從灰原哀這里得知解藥有希望了，柯南怎能不驚喜呢？
灰原哀拿出一根抽血針筒，對柯南說道：“抽管血，制作解藥需要對你本人進行研究實驗，盡可能的減少副作用。這段時間可能需要你來配合我進行一些研究。放心，研究還是很安全的，不會對你有傷害的。”
灰原哀本人抗拒人體實驗，自然不會把柯南當成實驗小白鼠一樣對待，但研究解藥是需要根據柯南和她自己的身體情況進行針對性研究，當然需要柯南本人來配合。