計劃如期進行，田中佑真從政府得到了一個定時炸彈，然后趁著大多數組織成員都在工作的時候安裝在基地，只等五分鐘之后爆炸。
然而就在這個時候，一位組織的小頭目正好回到組織，看到了田中佑真的行為。他立刻意識到不對，轉身就想離開。
但是田中佑真不能讓他走，因為本來的計劃是表現出這里是意外爆炸。一旦對方把這件事情匯報給組織，組織肯定就會產生警惕，從而更加嚴格的看守美國基地。
田中佑真目標堅定，追上去和小頭目纏斗起來，哪怕拳頭落在他臉上也絕不松手，終于，炸彈的火光把兩個人都淹沒了。
美國那邊，宮本翔和美惠子并不知道日本的情況。他們在收到政府任務繼續的通知后，開始著手準備盜取任務。
很快，美國基地果然調派了一部分人去日本，這里就變得空擋起來。美國的臥底引開了大部分組織成員，美惠子進入里面盜取機密，宮本翔在外面接應他。
經過了一系列驚險的行動之后，美惠子成功得到了載有組織機密的文件。然而就在她要出來和宮本翔匯合的時候，被組織成員發現了。
那個組織成員很厲害，美惠子完全打不過他。于是美惠子把優盤扔給在外面的宮本翔，自己則是纏住對方。
宮本翔目眥欲裂的看到那個組織成員把刀插進美惠子的身體里，他想要沖上去為美惠子報仇，但是理智強行讓他帶著優盤離開，找到政府接應。
等再回去的時候，地上只剩下美惠子的尸體了。
宮本翔帶著美惠子的尸體回國，卻又接到了田中佑真已經死去，甚至被炸彈炸的尸骨無存的消息。
接連的噩耗讓宮本翔崩潰了很長一段時間。而在這段時間，政府也終于給力了一次，在知道組織已經沒有用處了之后，很快耗費人力物力將這個作惡多端的組織連根拔起。
在組織徹底被鏟除并且上了報紙之后，政府又繼續追查那些為組織服務的科研人員，他們都是日本的瑰寶，完全可以戴罪立功。
大部分科學家都歸順了政府，不過比較可惜的是，一個叫籠島結月的女科學家在組織被破的消息上報之后，就自縊在了家中。
宮本翔同樣得到了這個消息，他并沒有因為這個消息而更加頹廢，反而是突然精神了起來，好像找到了新的人生目標。
他先是花費了一段時間，把美惠子的家族從瀕臨破產發展的蒸蒸日上，然后交給了美惠子的親弟弟。
接著利用之前積攢的人脈和金錢建立了反歧視協會，免費為那些本身有本事，卻因為身份受到歧視的人找工作或者打辯護。
這一切的進行總共花了十年的時間。最后他脫離了自己創立的協會，脫離了自己優秀企業家的身份，成為了一名警察。
宮本翔自覺沒什么能為死人做的，只好帶著他們的夢想繼續走下去。
在這位曾經風靡一時，經歷跌宕起伏，最后卻甘于平凡的偵探的自傳里有這樣一段話“我從不后悔自己追查那個組織，我只是感到遺憾。我本以為我會獻身于這條通往真相的道路，但是我卻幸運的活了下來。這絕不是什么不幸，因為如果把活下來當成不幸的話，那才是真正的對死者的不尊重。那么就讓我帶著這份幸運過好我的一生。他們會開心的，我相信。”