時間就這樣慢慢過去，但母盒一直沒搭理她，而阿追為了得知母盒背后的文明，考慮再三之后，選擇將母盒放回原處，于是沒多久母盒就回到正在瘋狂尋找失去母盒的人類手中。
因為她知道，她在這是不可能僅憑她一人就能取得母盒的核心科技的。所以還不如靜觀其變。
就在她再次銷聲匿跡的時候，由于沒有干涉，在盧瑟的陰謀下，國會聽證會爆炸如原著般發生，蝙蝠俠與超人矛盾漸生，最后大戰如期進行。
毀滅日也因此誕生。
與此同時，潘多拉宇宙。
仙女星系與銀河系直徑星域，這里有一個神舟文明這個升級用的小宇宙，直徑四萬光年。
此時最后一批一萬多億顆質子中子已經被展開成二維的微觀粒子，整整齊齊布滿空間卻不顯得擁擠的全反射鏡面布滿整個小宇宙，重重倒影仿佛無窮無盡。
如同一個鏡子組成的宇宙，一面倒映著另一面，如同套娃一般令人炫目。
這個景象已經存在三萬年了。
三萬年，熬死無數千年王八萬年龜的時間，在神舟文明這里，緊緊是為了升級一個人。
原本需要三到四萬年才完成的升級，因為神舟文明這些年的科技進步，使得這個時間整整縮短了幾千年。
慢慢的，這個直徑四萬光年的小宇宙中，那些全反射鏡面一個個逐漸消失，當然并不是真正的消失，而是被展開成二維的微觀粒子卷回了原本狀態。
卷回原本狀態后，這些粒子已經不是原本了粒子了，而是一臺臺微觀超級計算機，那是引力結組成n結做成的引力計算機與強相互作用力做成n接做成的強相互作用力計算機，雙通道。
不僅如此，由于在二維展開的時候用了最新三件套中的小宇宙膜技術鑲嵌的原因，現在這些被卷回微觀的粒子之中也充斥著這層膜。
這層神舟文明版小宇宙膜被跟著二維展開的粒子卷回微觀的時候，也變成了粒子本身，現在這層膜如同粒子一樣復雜，微觀粒子內部有多宏大，這層宇宙膜就被卷成多宏大。
如同一個宇宙。
而現在，這些基本粒子開始通過早就放置好的傳送門傳送到小宇宙中心處，隨后一個已經變成神舟文明版本智子開始俘獲一顆電子。
智子本身仍然擁有質子屬性，于是一個氫原子誕生。緊接著是兩個早就定位好的智子挨在一起，隨后強相互作用將它們牢牢錨定，它們一起俘獲兩個電子，于是一個氦原子誕生。
緊接著是8顆智子與8顆中子按照程序湊在一起，它們一起俘獲電子，自旋相反的兩個電子形成共用電子對，自旋相同的電子由于泡利不相容原理，自行分布在8顆質子與中子形成的原子核外第一顆氧原子誕生。
隨后是碳、氮、鈣、磷、鎂，還有一些鐵鋅銅猛之類的微量元素形成，它們根據既定位置既定排列組合在一起。
這無數億億顆微觀粒子有條不紊的穿梭組合，那是何等的精確。
不知多久之后，一個人型軀體形成。
他靜靜的佇立于小宇宙之中，隨后睜開眼睛。
但被做成智子中子的可不僅僅是他本身。所以此時也已經完成的其他微觀粒子向他一絲不掛的身軀涌來，匯聚于他體表。
粒子按照既定程序排列組合，形成一件打底內衣褲，外面一件黃金鎖子甲形成，不過鎖子甲才剛剛出現，便消失不見，轉而是一件襯衫，隨后襯衫又消失不見，幾經變化之后最終形成他第一次穿越到納米核心的時候穿的那件大衣。
他握了握拳，隨后消失在原地，等他再次出現的時候已經是在小宇宙外面，緊接著他前腳跨入神舟文明最新傳送科技星際門，同時一穿著皮革樣式的腳就出現在神舟星的大廳內。