然而二十年后，四國在增強國力后又一次掀起了戰爭，這一次，戰爭轉入局部式戰斗，增強國力后的雷之國云隱村孤注一擲，投入千余忍者向木葉發動侵襲。第二代火影扉間帶領著村中的精英忍者一起阻止云忍的入侵，守護著忍村，為木葉帶來了勝利。使云隱以戰敗為結果收場。
事后，云隱村內部產生了分裂，第二代雷影想停戰與木葉和談，但這對任性的兄弟卻不甘心以慘敗收場，他們希望繼續維持戰亂狀態，因此，在雷影與火影的結盟儀式上，金角銀角掀起政變，二人以六道忍具和九尾查克拉的力量兇殘的殺死了自己的老大二代目雷影，同時也讓第二代火影受到了瀕臨死亡的重傷。
緊接著，扉間帶領部下突出重圍，金角銀角乘勝追擊，為了保存木葉的幼苗，扉間決定留下斷后。不過，即便是在這種危急關頭，心思縝密的扉間仍為選擇正確的繼承人而暗中考驗著部下，最后團藏因膽怯而遲疑，而猿飛日斬表現出能為了村子舍棄性命的決心，據此，扉間將「火影之位」托付給了日斬。
之后第二代火影扉間獨自一人抵擋能夠自如操縱六道仙人的五大忍具、擁有九尾查克拉的金角銀角。
經過一場大戰，第二代火影千手扉間為掩護部下撤退力竭而犧牲，金角銀角也死傷慘重。
二十年后啊，一戰二十年后云隱單挑木葉沒打過，簽合約的時候千手扉間陣亡，之后有了第二次忍界大戰啊。
而且這會兒猿飛日斬四十多歲了，三忍也都二十來歲了啊。
真的，別在問我為啥水門入學的時候二代還沒死了，他本來就沒死啊。
火影時間線很短的，鳴人出生的時候也只是木葉51年，千手扉間死了才十幾年的，劇情開始的時候死了二十幾年。
但是實際上推時間能算出來水門入學的時候二代沒死的，而且水門畢業時間應該也很晚，畢竟二代死的時候他都十歲了，他還在上學的。