李元景考慮到現在沒有辦法確定血型，只能靠滴血配型，這滴血配型非常不準確，一旦出現失誤，輸入了不配型的血，發生了凝血反應，那連搶救的藥都沒有。
因此李元景和孫思邈商議，給李淵做手術，能不輸血就不輸血。
如果在后世，技術、工具先進，做闌尾炎手術一般是不用輸血的。
刑部一共送來了四十名死囚犯，除了九名切除闌尾，讓孫思邈三人練手之外，還有三十一人。
給九名死囚犯做切除闌尾手術時，李元景讓給其中的五名輸了血，另外四名沒有輸。
原本給這九名死囚做切除闌尾手術，是不用輸血的，之所以給那五名死囚輸血，也是為了積累輸血的經驗。
當然給李淵能不輸血就不輸血，并不是不做準備，李元景通過滴血配型，選出了五個感覺血型和李淵特別一致的，作為預備。
鹽水輸上了，麻藥已經起效，李淵慢慢地昏睡過去，不再吵吵害怕，一切準備就緒，開始做手術。
肚皮被割開了，和預想的一樣，他的肚皮里邊有很厚的脂肪層，孫思邈親自操刀，他把脂肪層割開，尋找闌尾。
扒開腸子，立刻發現闌尾已經發炎、腫脹，變得很大，孫思邈把闌尾切除，結扎好，再把他的腹腔分層縫合。
孫思邈鎮定地做完了手術，停下手，李元景才一陣后怕:
幸好手術很順利，很成功，如果手術不順利，不成功，李淵有個什么好歹，那李元景就罪孽深重、沒有辦法向大唐百姓交代了。
孫思邈做手術的時候，很鎮定，但做完手術，他也很恐慌:
這手術可不是像給莫邱氏做的那樣，莫邱氏身份地位低微，并且不做手術，必死無疑，所以給莫邱氏做手術沒有這么大心理負擔。
而李淵的這腸癰，雖然不做手術同樣是死路一條，但李淵因為腸癰死了，沒有誰會說什么，可如果做手術不成功死了，那李元景，包括李世民都沒有辦法解釋清楚。
做完手術，孫思邈交代劉金方、李元英和四名侍女，要密切關注李淵的情況，然后，他和李元景二人走出手術室，向李世民稟報手術的情況。
當李世民眾人聽說手術很成功，只要后期護理好李元很快就能痊愈，李世民非常激動地感激了孫思邈。
自然孫思邈非常謙虛地說，這做手術是的李元景的功勞，他只是按照李元景的教導，動了動手而已。
李世民問孫思邈、李元景，能不能進去看看李淵，李元景說可以進去看看。
李世民、長孫皇后二人首先進去，他們進去后看李淵躺在手術臺上，還昏迷著，二人就守在旁邊。
李世民二人守在這兒，沒有任何用處，李元景為了不讓二人一直守在這兒，他就告訴二人，這兒是手術室，要保持無菌的狀態，所以二人不能長時間在這兒，把二人趕了出去。