阿里還效仿西方，設立內閣，設置軍事、司法、財政、商業、教育、衛生六部，獨攬政治大權。他還經常去全國各地考察，了解政策的執行。并且建立起了一套嚴密的統治體系，通過嚴刑峻法很快改變了埃及的政治面貌，實現了國內的大一統局面。
那么如此努力富國強兵的阿里他成功了嗎？
阿里的改革和建設，推動和恢復了生產，使埃及的經濟出現了繁榮景象。
全國耕地增加130萬費丹（約合780萬畝），國家財政凈增200%，全國人口增加到450萬。
軍事上陸軍人數增加到20萬人，海軍2萬人、擁有三十二艘軍艦。入侵蘇丹，并且趁希臘獨立戰爭期間霸占了克里克島。發動第一次土埃戰爭侵占巴勒斯坦和敘利亞。
到此為止阿里可以說是非常成功，從一個孤兒到埃及實際上的統治者，并且將過去的宗主國打的滿地找牙。近代第一個完成西化改革的非洲國家。
但很可惜，歐洲想要的只是一只看門狗，而不是一匹想要吃肉的狼。
1840年7月15日英、俄、奧、普、土五國在倫敦簽訂倫敦條約。
對埃及發出最后通牒，阿里斷然拒絕。他不想自己的大國夢破滅，接受這個條約意味著他一生的努力將付諸東流，同時埃及將喪尸獨立，回到過去成為奧斯曼的附庸。
還有就是他已經被之前的勝利沖昏了頭腦，在面見英國大使時居然說“五國同盟想要使用武力，那就請便，我穆罕默德·阿里在此恭候。如果你們英國人想要單獨行動，那我更歡迎。”
阿里下令全國進入戰爭狀態，加固城防，儲備糧食，積極備戰，準備和歐洲人開戰。
然而同盟國還真沒有把一個非洲國家當做一盤菜，9月英國艦隊聯合俄、奧、土耳其（奧斯曼）三國艦隊進入地中海，炮轟貝魯特。1500名英軍在貝魯特登陸，橫掃了阿里在黎巴嫩沿海的部隊。
同時英國人發揮了自己的傳統特長，煽動敘利亞人起義并給他們提供槍支彈藥。敘利亞人早就對阿里的統治不滿，一時間戰火四起。
埃及軍隊在正面無法對抗英軍，海上他們的三十幾艘軍艦在四國聯合艦隊面前猶如玩具船。就算是列強中最弱的奧地利海軍，也能實現單方面吊打埃及海軍。僅僅是與聯合艦隊的先頭部隊，試探性的交火埃及人便損失他們四分之一的艦隊。
法國人曾經支持過埃及，但是此時見埃及大勢已去，便要求阿里做出讓步，與蘇丹談判。
聽人勸吃飽飯，阿里作為一代梟雄立刻放下了自己的面子開始和奧斯曼蘇丹談判。
阿里表示愿意從阿達納、克里特島。阿拉伯半島和敘利亞撤軍，以保住自己在埃及的世襲統治權和阿克（敘利亞的一個地區）的終身管轄權。