“什么？‘哥斯拉’被擊退了？被初號機？我？”
當都只是聽到羽戊良被擊退，還是他駕駛的初號機擊退時，他臉上充滿了震驚和懵逼，因為他根本不知道整個過程發生了什么，稀里糊涂變成了拯救第三新東京市甚至世界的英雄。
不管怎么說，羽戊良以及第五使徒的危機被化解了，最大的功臣就是碇真嗣和初號機。
雖然無法確定初號機是否會再一次暴走，但是對于人類來說，這或許是唯一也是最后的“王牌”。
在經過一段時間的觀察后，確定碇真嗣沒有危險后，NERV撤銷了對碇真嗣的隔離，重獲自由之身。
之后經過很長時間的平靜期，初號機已經完全修復完畢，而零號機已經頭部問題，需要更久的時間。
難得的悠閑時間，碇真嗣去到綾波麗的住處，發生了一些羞羞的事情，相互之間增進了一下感情，為將來打好基礎（？？？）！
（這一段的劇情作者君就不水字數了，有興趣的小可愛可以去看看《福音戰士新劇場版：序》，另外在百科上面大致看一下有關EVA整個世界的設定等等，本書不贅述了。）
使徒的入侵或許會遲到，但絕不會缺席。
“監視對象侵入小田原防衛線！”
NERV指揮中心，監測員報告了使徒入侵的情況。
“未確認飛行物體分析完成……”
“模式為藍，確定為使徒！”
“這次，果然是第六使徒啊。”
冬月耕造與碇源堂一起出現來到了指揮中心，看著屏幕上顯示的畫面，開口道。
碇源堂依然是那副冷漠的樣子，伸手扶了扶眼鏡，下令道：“嗯，派初號機出擊。”
碇源堂絲毫沒有在乎碇真嗣那次因為初號機暴走后的情況如何，在第六使徒到來的時候，毫不猶豫派出初號機進行迎敵，在他眼里，碇真嗣或許就是一名適格者而已。
對于NERV總司令的命令，所有人都必須執行，包括葛城美里。
在一系列的準備工作完成后，當第六使徒入侵到蘆之湖上空時，葛城美里下達了初號機的出擊命令。
“嘟——”
正當初號機在軌道上升的時候，能量檢測器有了反應。
“這是，目標內部有高能量反應！”
“什么！？”
葛城美里大驚失色，這完全是被第六使徒擺了一道，對方打算先發制人。
“難道是……”赤木律子看到過類似的高能量反應，沒錯，就是羽戊良釋放原子吐息前的現象。
“快躲開！”
葛城美里慌張地朝碇真嗣喊道。
“蛤？”剛剛被送上來的碇真嗣一臉懵逼，根本不知道接下來要發生什么。
……