南極，酷寒的風雪中，有一座潔白的建筑佇立在被冰雪覆蓋的山崖上。
風雪是白的，建筑是白的，被冰雪覆蓋的山崖自然也是白的，一切都白茫茫的。
如果不仔細看，很難在這一片白茫茫中辨別出哪個是建筑，哪個是山崖，哪個是風雪。
不過這件事并沒有什么人在意。
這個時候，已經沒有什么人需要去分辨建筑在哪里了。
這個時候，除了建筑內部，整個地球上已經沒有了人。
這個時候，整個人類世界，都已經化為灰燼。
整個人類世界，只剩下建筑里的一點殘存。
很絕望。
太絕望了。
即使最有勇氣的人也會忍不住感到絕望吧。
因為連從頭開始的可能都沒有。
連憑借建筑里的人重建人類世界的可能都沒有。
建筑之外的世界，已經被燒成了灰燼。人類文明的一切精華，都已不復存在。
有人，借人類史的力量否定了人類史。
有人，在時間軸上燒卻了人類的存在。
有人，扭曲了時空，即將讓人類的痕跡，從這個世界上消失。
甚至這個時空的人類已經消失了。
建筑中的這個小小的人類世界，只是憑借那個叫迦勒底亞斯的模擬世界守護的。
那是模擬地球環境的模型，但也幾乎可以視作一個完整的世界。
因為是一個世界，所以才可以抵擋人理燒卻的力量。
但也只是一時。
在新年到來之際，時空的扭曲依然會毀滅這里。
毀滅迦勒底亞斯，毀滅這個建筑中的小小的人類世界。
真是太絕望了。
但絕望之后，人類還是會前進。
人類，不愿被否定。
所以在建筑……
不，應該說是人理存續保障機構菲尼斯·迦勒底中，人類依然在努力。
是的，人類已經預感到了毀滅，所以才有了建筑，才有了迦勒底亞斯。
人類，早已準備著，應對毀滅。
雖然毀滅來的太急切了，連用來應對這個毀滅的迦勒底都被毀滅了大半——所長和大部分工作人員，準備應對末日的擁有靈子轉移資質的47位御主都毀滅了，但僅存的工作人員，和僅剩的唯一一位，第48號御主依然在努力著。
僅存的人，依然組成了人理存續保障機構。
他們努力拯救這個被燒卻的世界。
憑借靈子轉移，進入人類史中尚未被燒卻的，尚在抵抗的，被他們稱為特異點的歷史片段。
幫助尚在抵抗的歷史，恢復正確的歷史，就能逆反人理燒卻，讓人類重新贏得明天。
為此，最后的擁有靈子轉移資質的御主，橙發的少女藤丸立香，與融合了英靈力量的亞從者、人造人瑪修·基列萊特，不斷戰斗著。
在中世紀的法蘭西，在公元初始的羅馬，在大航海時代的海洋，在工業革命后的霧都，在神話重臨的美洲大陸……都留下了他們的血淚與歡笑。
甚至不止歷史的片段。
人理燒卻波及的人類之世如天上的繁星一樣多。
虛空之中，無數特異點不斷生成。
無數人類在混亂的時空中煎熬。
對藤丸立香和瑪修來說，雖然主要任務是為人類贏得明天，但他們也從未放棄修復那些被他們發現的特異點。