僅僅五天之后，7月18日，百濟國王扶余義慈率太子扶余隆及熊津方面部隊自熊津城請降，之后百濟各地的軍政首腦順應國王意志，紛紛向唐朝臣服，并主動向進駐泗沘的唐軍送糧送款。
百濟大局已定。
在百濟王族出降之時，受其蹂躪多年的新羅軍長吐一口百年怨氣。新羅太子金法敏更是報了背負了20年的國恥家仇，他責令百濟太子扶余隆跪于自己的戰馬之前，并且厲聲唾罵：“向者汝父枉殺我妹，埋之獄中，使我二十年間，痛心疾首，今日汝命在吾手中！”
作為亡國太子的扶余隆，“伏地無言”。
自3月10日高宗皇帝下發遠征百濟詔書，至8月12日平定捷報抵大唐京城，前后共計五個月時間，割據海東近五百年的朝鮮古國百濟在須臾間灰飛煙滅。
但是如果你認為這樣就結束了，那就太天真了，百濟一滅，那么高句麗就失去了一個軍事盟友。高句麗側翼完全暴露在唐朝的直接攻擊之下，高句麗側翼也失去了戰略防御屏障。
三個月之后，顯慶五年的十二月，李治立即派遣薛仁貴，蘇定方、劉伯英、程名振率軍分道進攻高句麗。
龍朔元年，唐朝募河南北、淮南六十七州兵，得四萬四千馀人，前往平壤、鏤方行營。以鴻臚卿蕭嗣業為夫馀道行軍總管，率領回紇等諸部兵前往平壤。
當初，蘇定方平百濟，留下郎將劉仁愿守百濟府城，又以左衛中郎將王文度為熊津都督。王文度渡海時去世。
百濟僧道琛、舊將福信聚集人眾據守周留城，從倭國迎來原先的王子豐立之，率軍在府城包圍劉仁愿。
唐高宗下詔任命劉仁軌檢校帶方州刺史，統帥王文度的軍隊，順便征發新羅兵，以援助劉仁愿。劉仁軌御軍嚴整，所攻擊的都成功打下了。
百濟在熊津江口立兩柵，劉仁軌率軍與新羅兵一起攻打，攻破之，殺死、溺死敵人一萬多人。
道琛等人解除府城的包圍，退守任存城。新羅糧盡，返回。道琛自稱領軍將軍，福信自稱霜岑將軍，招集徒眾，勢力越來越大。
劉仁軌兵少，與劉仁愿合軍，休息士卒。唐高宗下詔新羅出兵，新羅王春秋奉詔，派他的將軍金欽統帥軍隊援助劉仁軌。到達古泗，福信截擊，擊敗了金欽。金欽返回新羅。
唐高宗派任雅相、契苾何力、蘇定方、蕭嗣業率軍水陸分道并進。七月，蘇定方在浿江擊敗高句麗，多次作戰都勝利了，包圍了平壤城。
九月，契苾何力到達鴨綠水，莫離支男生用數萬精兵守之。契苾何力到達后，正趕上層冰大合，契苾何力率軍乘冰渡水，打敗高句麗軍，斬首高句麗軍三萬級，其余都投降于唐軍，男生孤身逃回。
龍朔二年（662），龐孝泰與高句麗在蛇水之上交戰，戰敗，與他的兒子十三人都戰死。另一道的蘇定方包圍平壤卻沒有攻下，遇到大雪，解圍而返回。
熊津都督劉仁愿、帶方州刺史劉仁軌在熊津之東大破百濟：劉仁愿、劉仁軌先是攻占百濟的支羅城及尹城、大山、沙井等柵，殺死以及俘獲很多敵軍，分兵守之；百濟增加軍隊防守險要的真峴城；隨后劉仁軌仍然攻占了真峴城，打通了新羅運糧之路。劉仁愿上奏請增加士兵。詔發淄、青、萊、海之兵七千人去熊津。