第二腔室，是環繞在中心腔室外圍的七個球形空腔中的一個。
該腔室作為“儲藏腔”而存在，那些阿納隆絲上的富魔礦物、尤其是曜晶礦，從全球各地運向了此處，在這里堆積了起來。
而與第二腔室相連接的第三腔室則被某種奇特的菌絲逐漸填滿。
菌絲成長到一定程度時，將會在智腦的控制下進行變異，成為硬度、功能、粗細、大小、形狀均不相同的菌類群落，按照極富邏輯的方式搭建在了一起，形成了可以對第一腔室的那些礦物進行處理的**機械。
**機械的是參照曜晶裝置而構筑的，張立思考再三，決定不采用單純的礦物構筑這些精密而脆弱的玩意兒。
它們可是整個方舟的能量核心，萬一壞在茫茫宇宙中，又缺乏金屬進行維修的話，那麻煩可就大了，譬如窺探者號遭遇的難題，就是個典型的案例。
一些管理者被放進了這兩個腔室，它們先是用鋒利的口器將存儲在第二腔室內的礦物碾碎，并在體內提純，搬運至第三腔體里的**機械的燃料倉中。
每臺機械都與星脈相通，星脈又遍布整個方舟各處，于是便形成了穩定的能量運輸渠道。
這種能量來源的構建極具必要性，若想完成宇宙航行，必須要保證方舟內部穩定的能量供給，光靠星脈對于宇宙空間內的游離魔力進行吸收，肯定是不夠的。
這也是為什么方舟只有這么大的原因，假如繼續增加體積的話，其內部空間、質量便會不可避免地增大，而表面積的膨脹和體積膨脹的比例則會進一步縮減。
其原理與細胞相似，當細胞表面積與體積比越來越小的時候，通過細胞膜流入細胞內的物質，將無法支撐過大細胞的能量消耗，所以地球上的細胞發育到一定程度，便會進行分裂，因為過大細胞，實在是沒有辦法成活。
第四腔室——第七腔室，便不再被張立設計為功能性腔室了，而是高等生命的搖籃。
未被蟲細胞污染過的土壤、海水、河流……等等物質從外部搬運了進來，均勻地鋪在這四個腔室的底部，堆積到圓形空腔中線的部位，形成了具有各種地形的土壤。
這些人造的土地依然具有著十分龐大的面積，基本上每個腔室都保證在12萬平方公里上下的指標（韓.國國土面積為9.9萬平方公里），足以建立獨立的完整生態圈了。
在這四個腔室的外部，大量星脈將其團團包裹，當方舟登上宇宙之后，星脈將會驅使著腔室進行轉動，以離心力帶動重力的產生。
生科院將幻想時代的物種大量克隆，投放在了這些土地里，目前投放的物種基本上都是植物、低等動物之類，它們改造著大氣，與智腦協同平衡著氣候與溫度。
而虛假的天穹則用魔力作為能源，散發出了與陽光成分近似的光芒。
無論如何，張立都不會放棄智慧生命的發展，現在有了無靈魂的蟲群們作為保障，他已不那么懼怕幽鬼的侵襲，在這些腔室的土壤中，被預埋了許多強力的蟲族卵莢，加上洛迪這位英靈的掃視，一旦發現幽鬼，這些卵莢便會孵化，對幽鬼進行狙殺。
而第八腔室——也是除中心腔室外的最后一個小型腔室則被留空，作為應急空間而使用，當然，它還有一個重要的功能：特殊通道。
通道連接著位于中央位置的第九腔室，這里便是張立本體未來的居所了，一條直通方舟的龐大星脈正不斷拓展著，而他的星靈之軀，將通過這條星脈，經過第八腔室，轉移到第九腔室之中。