在沼之國，宇智波富岳跟彌勒來到封印魍魎的石門所在。
宇智波富岳開啟萬花筒寫輪眼，瞳術黃泉津自動被激發，一道道靈化作的熒光在眼前浮現。
這一幕，是《鳴人之死》劇場版的最后一幕。
這些靈，都是鬼之國歷代封印魍魎而死的女巫的靈。
封印魍魎的力量，是女巫的精神力量跟生命力量的結合，歷代女巫磅礴的生命力量積攢下來，維持她們的靈。
宇智波富岳最不缺的就是生命力量，通過生命力量，結合歷代女巫的靈，將魍魎徹底封印。
之后跟魍魎達成協議，將魍魎當做尾獸，封印在自己的體內——
不僅能駕馭不死軍團，自身的查克拉量也達到了恐怖的地步，瞳術整合的限制被解放。
解決魍魎之后，宇智波富岳在鬼之國陪伴彌勒跟紫苑一段時間后，前往雪之國。
——
雪之國。
宇智波富岳的勢力徹底掌控雪之國，開始一系列的改革。
改革主要集中在兩點。
第一點是教育。
忍界的教育還有很大的改良空間，比如術業專攻。
另外，也有很多不具備成為忍者天賦的普通人，他們也有可發掘的點。
第二點是醫療。
宇智波富岳首先建立：新雪院。
新雪院，由藥師野乃宇當任院長，接納流離失所的孤兒，以及一歲以上的孩童，進行教育。
通過早教，提升雪之國孩童的整體水平，在三歲后，進入綜合學校。
綜合學校。
三歲入學，六歲畢業。
根據老師的考核，分成理工科和忍者科。
理工科進入科技研究院。
科技研究院，赤砂之蝎當任院長，風花早雪當任副院長。
主要的方向是研究科技，諸如讓普通人也能使用忍術的忍具、醫療器械等等。
忍者科則是進入忍者學校。
忍者學校。
體術、忍術、特殊、幻術四科。
根據綜合學校考試成績，以及個人意愿，選讀。
科技研究院和忍者學校，都是十二歲畢業，畢業后可以留校繼續深造，走向幕后，有醫療忍者天賦的，則可以前往冰十字醫療院，進行醫療忍術的修煉。
冰十字醫療院，院長暫時由藥師野乃宇兼任。
一系列改革之后，宇智波富岳又組建醫療小隊跟忍者小隊，派去戰場歷練。
醫療水平的增長需要實踐，而戰場是最佳的實踐場所，讓忍者小隊護衛，也能增加忍者的實戰水平，并且有赤砂之蝎的蛛網護衛，他也不擔心安全問題。
歷練的主要對象還是那些平民，遇到孤兒，或合適的人，則帶回雪之國。
——
雪之國在慢慢發展。
宇智波富岳把目光放到進入白熱化的三戰。
通過對時機的把握，用瞳術得到雷遁忍體術、飛雷神之術。
同時，也把一些人物收到麾下，增加雪之國的戰力。
——
木葉47年。
木葉跟巖忍和談，巖忍派人盜取白眼。
雖然擊殺了巖忍，但日向日足也清楚之后的事情，這時宇智波富岳找上了日向日足和日向日差。
在一番激將后，日足和日差詢問辦法，宇智波富岳讓日向花火假死。
日向一族以日向花火被巖忍所殺為由，向木葉施壓。
日向危機瓦解。
宇智波富岳帶著日向花火回雪之國。
同年，三代退位，四代火影競選，大蛇丸人體試驗被揭發，宇智波富岳協助逃亡。