在《蟲蟲特工隊》首映式，保羅提前來到了劇院，大門隔絕了外面的紛紛擾擾，保羅圍著前廳打了圈招呼，然后看到了盛裝打扮的布蘭妮·斯皮爾斯和克里斯蒂娜。
和她們聊了幾句，很快就到了電影開始的時間。
在一個美麗的螞蟻王國，大家整日都在辛苦的工作，一只名叫菲力克的螞蟻有著自己的愛好——發明創造。
盡管他辛辛苦苦法發明了一種“收割機”，但王國的統治者蟻后和安塔公主還是看不起他和他的發明。
螞蟻王國最大的威脅是一群蚱蜢，這群蚱蜢總是搶奪螞蟻們的糧食，他們是螞蟻王國頭頂的烏云。
在一次蚱蜢進行掠奪時，菲力克不小心把糧食碰到了懸崖下，惱火的蚱蜢首領霸王抓住了公主的妹妹小不點來出氣，并威脅說如果他下次來得不到雙倍的糧食，就會血洗螞蟻王國。
由于菲力克把糧食都弄丟了，大家把心中的恐懼和不滿發泄在了他的身上，螞蟻王國決定驅逐菲力克。
為了留在自己的族群，菲力克來到了城市，想要找到一群強大的蟲蟲戰士，好打敗蚱蜢，結果陰差陽錯之下，它找來了一群失業的馬戲團演員。
來到螞蟻王國后，螞蟻們并不十分相信這些模樣古怪的昆蟲，并且昆蟲們自己也有些害怕，打了退堂鼓，準備離開這里，雖然得知昆蟲們的真實身份后菲力克很失望，但他極力阻止昆蟲們離開，否則他會被螞蟻們認為是個大騙子。
后來他們遇到了昆蟲的天敵鳥兒，這群馬戲團演員救出了菲力克和小不點，得到了螞蟻們的好感，也找回了自信心，而且菲力克受到了鳥兒的啟發，決定做一支假鳥來嚇退蚱蜢。
假鳥完成了，霸王也帶著它的惡棍軍團逼近了螞蟻王國，誰知道馬戲團的老板來找他的昆蟲演員了，當螞蟻們得知昆蟲們是馬戲團的演員時，失望萬分。
螞蟻王國驅逐了菲力克和昆蟲們，恰恰這時，蚱蜢軍團到了，在小不點的勸說下，菲力克和昆蟲們決定一起迎戰蚱蜢，雖然假鳥開始嚇住了蝗蟲的進攻，但種種意外下，霸王識破了假鳥，準備一舉摧毀螞蟻王國。
電影漸漸接近了尾聲，如同所有好萊塢的主流電影一樣，總會無限貼近主流價值觀，《蟲蟲危機》自然也不會例外。
通過一群昆蟲，它盡情展現著責任、團結和自由等價值取向，盡管多少有些說教的嫌疑，皮克斯工作室卻通過一些有趣的場面，使得這些極好的融合進了電影里，讓觀眾開懷大笑的同時，又不知不覺間為這些昆蟲的命運感到擔憂。
好人永遠都會戰勝壞人，壞蛋總不會有好下場，這畢竟是全年齡段電影，結局幾乎是好萊塢約定俗成的。
面對著蚱蜢首領霸王的欺壓，菲力克鼓足勇氣挺身而出，用自己的話和行動證明了小螞蟻也可以做大事情，螞蟻王國團結在一起，勇敢的反抗，數量比它們少太多的蚱蜢，根本不是對手，只能倉皇而逃。
霸王不甘心失敗，抓住了菲力克，卻被小螞蟻引入了鳥巢，最終成為了雛鳥的腹中美餐。
電影的情節并不復雜，而且很好的繼承了皮克斯工作室的風格，讓人感到樂趣的同時，還會帶來些值得思考的東西。
這是皮克斯的一貫風格，極為切合迪士尼的傳統，而在觀眾看劇情的時候，保羅更多的是注意動畫的技術。